商业秘密权与专利权相比，是两种不同的保护手段，商业秘密保护的优点在于：

一、产生方式不同

商业秘密的取得，基于权利人的合法劳动或其他正当手段，是一种“自然”取得，无须任何部门审批；专利权的批准则必须由专利局进行审查后决定。

二、获得权利时对是否公开的要求不同

申请专利必须将技术内容充分公开，达到专利法的要求，即技术无法保密。

商业秘密保护，则不需要将技术公开，别人模仿不易。

三、对竞争对手的贡献程度不同

申请专利，专利公开后竞争对手可自由将技术用于再创新，对专利权人进行技术超越；商业秘密则不存在这方面的问题。

四、在地域保护上的不同

专利申请人不可能向世界所有国家均申请专利保护。申请专利将技术公开后，对同一技术方案，会导致在未取得专利权的国家，丧失一切保护；只要技术未被公知，商业秘密则不存在这样的问题。

五、有些技术领域不授予专利权

我国对动物和植物新品种，专利法未给予保护。有关技术，只能采用商业秘密形式保护。

六、覆盖的范围不同

商业秘密包括技术秘密和经营秘密，而专利权覆盖的内容仅限于技术秘密中的一部分内容，即符合发明、实用新型、外观设计专利保护要求的内容，在此要求之外的技术秘密则不予保护。

七、商业秘密权可对未完成的技术方案提供保护

未完成的技术方案符合商业秘密的构成条件，就可获得保护，而专利保护的只能是完整的技术方案。

八、商业秘密保护的门坎比专利保护低

专利法规定了较高的创造性标准。对商业秘密只有秘密要求，门坎比较低，适用面更广。

九、商业秘密可有综合内容，而专利必须具有单一性

商业秘密保护比较灵活，一项综合技术，可以构成一个商业秘密整体。专利申请要求不同性质的技术、本质不同的技术方案各自申请专利。专利申请的时间长、手续复杂、耗费精力大，会导致对可申请、可不申请专利的技术，作为商业秘密保护。

十、维持专利有效需要缴年费

专利年费每年要缴，有些技术需要在很多国家同时得到保护，由于费用的原因，总有部分技术不会申请专利，以商业秘密形式保护。

十一、诉讼的前提不同

认定是否存在专利侵权或专利申请技术是否受到损害，必须等到专利技术被公告，或专利申请技术被公开，技术公开是专利诉讼前提。而商业秘密侵权诉讼，与发生诉讼时技术公开与否无关。如果侵权人尚未公开有关技术，法院可用判决禁止公开。